雅格隆大学欧洲研究所成立于1993年，它创建的历史与雅格隆大学跨学科欧洲研究系的建立有密切关系。1999年，该系更名为雅格隆大学哲学学院欧洲研究系。2001年，欧洲研究系纳入区域研究所的机构体系——雅格隆大学新成立的国际政治研究院。2004年，欧洲研究系更名为欧洲研究所，成为雅格隆大学国际政治研究院的组成部分。

雅格隆大学欧洲研究系和后来欧洲研究所的创立，其目标和任务都是旨在促进欧洲研究领域的教学和研究。这一目标的设定决定了它从多学科的视角走进欧洲研究的特性，其学科领域包括：人类学、经济学、文化学、政治学、社会学和法学。

    1、欧洲研究所自成立以来的主要教学活动包括： 

1994年： 推出四年制博士课程；

1996年： 推出欧洲研究领域二年制非学位文凭课程；

2000年：推出全日制第二周期研究生课程（full-time second-cycle graduate programme）：欧洲研究专业文化学课程；

2000年：推出非学位文凭课程——有关“大屠杀”[1]（the Holocaust）历史知识讲座；

2000年：推出欧洲研究领域文科硕士国际课程；

2001年：推出教师非学位文凭课程——“欧洲人文研究”；

2002年：推出本科留学生国际学习课程；

2002年：开办全日制和业余学习欧洲研究专业文化学本科学士学位课程；

2003年：与维也纳大学签订双边协定，开办欧洲研究双学位课程；

2004年：学士学位和硕士学位（本科生和研究生）课程互换：即欧洲研究专业的文化学课程与欧洲研究课程互换；

2004年：加入高校欧洲文化学专业硕士课程网络；

2005年：加入高校社会教育与硕士跨学科机制课程。

    2、欧洲研究所自成立以来开展的主要科研活动： 

1994-1997：Tempus-Phare项目[2] 对欧洲文化与社会的协调（欧洲委员会资助）；

1995-1998：Tempus-Phare项目对当代欧洲政教关系的协调（欧洲委员会资助）；

2002-2003：和平/宽容儿童教育项目（加拿大蒙特利尔儿童权利署资助）；

2002-2003：1957—1992年欧洲市政与区域定期会议项目（东京基金会资助）；

2003-2006：移民子女课程项目（欧洲委员会资助）；

2005： 欧洲遗产继承项目（欧洲委员会资助）。

    3、欧洲研究所目前在研的科研项目： 

1） 移民与欧洲化：在机构与互动视角中形成的欧洲认同；

项目协调人：Dr. Marcin Galent

项目期间；2013-2016年。

2） 城市治理与城市可持续发展政策——布鲁塞尔案例（MO-2011/03/N/HS5/01140)；

项目经理：Katarzyna Romańczyk

项目期间：2012年9月——2014年3月；

资金来源：国家科学院。

    4、欧洲研究所主要出版物： 

《雅格隆欧洲论坛》(Jagiellonian European Forum)、《欧元通讯》（Euro Facta）及独立出版物，如：《欧洲基金与地区政策年鉴》(Encyclopedia of Regional Policy and European Funds)、《移民与认同：从理论到实证研究》（Migrations and Identity: From Theory to Case Study）、《移民与欧洲化》（Migration and Europeanisation）等等。